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NIST RM 8461人肝臟用于蛋白質組學標準品

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NIST RM 8461人肝臟用于蛋白質組學標準品旨在支持復雜樣品中肽和蛋白質鑒定的研究,例如基于質譜的蛋白質組學中的那些。

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NIST  RM 8461人肝臟用于蛋白質組學標準品旨在支持復雜樣品中肽和蛋白質鑒定的研究,例如基于質譜的蛋白質組學中的那些。 RM 8461 可用于幫助評估實驗室內肽和蛋白質鑒定的可信度或實驗室之間或不同測量方法之間的可比性。 RM 8461 還可用于開發和驗證用于識別肽和蛋白質的新研究方法。一個 RM 8461 單元由一個裝有約 0.5 克凍干人肝材料的小瓶組成。



儲存: 

RM 8461 應儲存在受控的室溫(20 °C 至 25 °C)下,避免陽光直射,直至需要。


使用:

NIST  RM 8461人肝臟用于蛋白質組學標準品在取出測試部分進行分析之前,應*混合內容物。建議使用等于或大于 1 mg 的分析測試部分。


分析:

對于蛋白質特性等定性測量,不能使用符合 JCGM GUM 的測量不確定度的常規評估和表達。表 1 列出了使用鑒定算法建立的 1619 種蛋白質的身份,其可靠性得到該領域專家的普遍認可。 RM 8461 中鑒定的蛋白質是使用多個搜索引擎和多種樣品制備方法從自下而上的蛋白質組學分析中推斷出來的。從 8 罐 RM 8461 的單個 1 mg 制劑 (n = 3) 中過濾出常見的蛋白質,并重復注射 (n = 3)。僅當滿足以下條件時才包含蛋白質:

• 錯誤發現率 (FDR) 低于 5 %,

• 整個測量組的光譜豐度優于 20% CV(包括技術和工藝重復分析),

• 在RM 8461 的整個生產過程中,使用Sequest HT、Mascot、MSAmanda 和Byonic 算法從八個罐子的分層隨機抽樣中鑒定出至少三種*的肽。






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