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高壓蒸汽滅菌的優點是溫度高、穿透力強、滅菌速度快、效果可靠等，但是錯誤的使用，就會導致滅菌的失敗和滅菌器的損壞。
使用高壓滅菌器應注意以下幾點：
一、首先物品要進行初步的消毒處理。只要接觸過病原微生物的醫療器械、被單、衣物等都需要先用化學消毒劑進行消毒，然后按照常規清洗。如果是傳染病房用后的各類物品，一定要嚴格把關，反復消毒清洗。清洗完畢分類包裝，運送工具嚴格區分，防止交叉感染。
二、用合適的包裝和容器裝載消毒物品。采用雙層白色棉制包布，新的包布需要先洗滌去漿后再使用。用線繩捆扎物品時，物品不會松動即可，不要太緊。選用容器時需要既可阻擋外界微生物侵入，又有較好的蒸汽穿透性的。比如特制的注射器滅菌盒、裝敷料的貯槽等。
三、要合理裝放消毒物品。消毒鍋內物品不能超過鍋內容量，盡可能將同類物品裝一鍋內滅菌，若有不同類物品裝放在一起，應以較難達到滅菌物品所需的溫度和時間為準。交叉裝放物品，使蒸汽容易穿透。大*應立著放上層, 小包放下層。大搪瓷盒和貯槽也應立著放布類和金屬類物品。
四、保持真空狀態。使用高壓蒸汽消毒鍋時，需將鍋內空氣排盡。如鍋內有空氣，則鍋內實際溫度達不到所需要的真實溫度。
五、合理計算滅菌時間。首先要計算穿透時間，即從鍋內達到滅菌溫度開始計算時間，到鍋內較難達到的部位也達到此溫度的時間。然后是維持時間，即殺滅嗜熱脂肪桿菌芽胞所需時間。再然后是安全時間，即滅菌得到確切保證后所需增加的時間。一般為熱死亡時間的一半，根據消毒物品所需時間來定。對易導熱的金屬器材的滅菌，不需要安全時間。在滅菌過程中，遇到氣壓、溫度下降的情況時， 應重新升溫升壓，重新計時。
六、滅菌完成后應等待消毒物品干燥，然后檢查指示劑達到滅菌要求方可出鍋。取無菌物品時，要嚴格執行無菌操作，開蓋物品先將蓋蓋好，貯槽關閉好通氣孔。同時應分類放置，順序發放取用。超過有效期或遇到潮濕情況不要取用。
七、防止超熱蒸汽。超熱蒸汽遇到消毒物品時不能凝成水，不能釋放潛熱，對滅菌不利。防止超熱的辦法是使用外源蒸汽滅器時，不要使夾層的溫度高于消毒室的溫度，兩者應相近不要使壓力過高的蒸汽進入消毒室內，滅菌時不要用壓力高的蒸汽加熱到要求溫度，然后再降壓力。
八、滅菌前應檢查滅菌器安狀態是否良好及不要隨意打開鍋門。每次滅菌前應檢查滅菌器是否處于良好的工作狀態，尤其是安全閥是否良好。等壓力表歸“0“位時，才可以打開鍋門，突然打開會使物品潮濕。
九、不能使用高壓蒸汽滅菌器消毒任何有破壞性材料和含堿金屬成份的物質。消毒這些物品將會導致爆炸或腐蝕內膽和內部管道，以及破壞墊圈。
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